我们家的巴西龟底壳腐蚀有小洞很深

应该是甲壳表面受伤。原因是饲养时水的硬度比原生活环境中水的硬度大，导致细菌感染。处理不好时严重的会导致肌肉外露甚至死亡。可以在患处涂点红霉素，看看是不是会好点。